L'agence onusienne œuvrant pour l'enfance la plus défavorisée a son siège à New York, est présente dans 191 pays, et possède quelque 126 bureaux de terrain, également entendus sous le nom de bureaux nationaux ou bureaux pays, qui sont tous supervisés par l’un des 8 bureaux régionaux. L’UNICEF a en effet opéré un découpage du globe en 8 régions :
Par ailleurs, les comités nationaux s’élèvent au nombre de 37, répartis dans chacune des différentes régions.
Outre le centre de recherche Innocenti basé à Florence (Italie), l'UNICEF dispose de trois centres d'approvisionnement, situés à Johannesburg, Dubaï et Panama, qui permettent d'assurer le bon fonctionnement de son appareil logistique. La gestion de ces centres est réalisée depuis le centre d'entreposage de Copenhague.
Le Président du Comité français pour l'UNICEF est Jacques Hintzy. Le directeur général de l'Unicef en France est Gérard Bocquenet depuis janvier 2008. Pour promouvoir son action auprès du public et lui permettre de faire appel au don en confiance, le comité national Unicef France, en tant qu’association, adhère au Comité de la Charte.
Dans les années 1990, l'UNICEF a été accusée par des lobbies de promouvoir l'avortement. L'UNICEF n'a pas de position officielle sur l'avortement mais travaille avec des organisations gouvernementales ou non-gouvernementales qui, parmi leurs activités, conseille les jeunes femmes au sujet de l'interruption volontaire de grossesse, particulièrement en cas de viol.
Le Vatican avait supprimé sa contribution annuelle de 2 000 $ parce que l'UNICEF avait diffusé une brochure d'information sur un spermicide à destination des jeunes femmes et adolescentes victimes de viol.