Les siRNA pour small interfering RNA sont de petits ARN double brin de 21 nucléotides. Les « siRNA » à l'état de double brin sont reconnus dans le cytoplasme de la cellule par un complexe protéique nommé complexe RISC (RISC) pour RNA induce silencing complex. Celui-ci s'active en libérant le brin complémentaire de l'ARN ou brin sens. Ce complexe activé va reconnaitre son transcrit cible, un ARN messager, par complémentation des bases nucléiques. Ce système de reconnaissance assure la haute spécificité de ce mécanisme. Une fois la cible liée, la protéine Ago, faisant partie du complexe RISC, va couper le transcrit au niveau du site de reconnaissance. Ago est donc une endonucléase. Les deux morceaux du transcrit clivé par Ago vont être rapidement dégradés via leurs extrémités par des exonucléases. La transfection de siRNA dans les cellules a donc pour conséquence la destruction spécifique des ARN messagers ciblés, empêchant toute nouvelle traduction de la protéine codée par ces ARN messagers
En résumé, les siRNA sont de petits ARN pouvant se lier spécifiquement à une séquence d'ARN messagers et ainsi empêcher l'expression de gènes en clivant cet ARN. Les siRNA sont des ARN interférents au même titre que les miRNA