Retroviridae - Définition
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Introduction
| Rétrovirus | |||||||||
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| Classification des virus | |||||||||
| Type | Virus | ||||||||
| Groupe | Groupe VI | ||||||||
| Famille | |||||||||
| Retroviridae | |||||||||
| Genres de rang inférieur | |||||||||
sous-familles et genres :
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Retroviridae est une famille de virus, dont les membres sont appelés rétrovirus. Ce sont des virus à ARN monocaténaire, de polarité positive, infectant les vertébrés. Ils se distinguent notamment par la présence d'une enzyme virale : la transcriptase inverse (TI, voire aussi RT pour reverse transcriptase) qui rétro-transcrit leur génome d'ARN en ADN pour être intégré par la suite dans le génome de la cellule. La TI a la particularité de commettre relativement facilement des erreurs, ce qui fait que certains rétrovirus ont une grande variabilité génétique. Les Retroviridae disposent d'un fort pouvoir oncogène.
Le virus de l'immunodéficience humaine (VIH), responsable du Sida, est un rétrovirus.
Morphologie
Ce sont des virus enveloppés d'environ 120 nanomètres de diamètre. Leur enveloppe est issue de la dernière cellule infectée car la prolifération se fait par bourgeonnement. Elle est enrichie par des protéines d'enveloppes spécifiques codées par le gène env du virus. Autour de l'ARN se trouve la capside. Le génome est diploïde, les deux brins monocaténaires d'ARN sont reliés par des ponts hydrogènes à leur extrémité 5'.
Le brin d'ARN étant monocaténaire, des erreurs de transcription surviennent fréquemment (il n'y a pas de contrôle possible à l'aide du nucléotide complémentaire) ; si certaines aboutissent à un ADN improductif, d'autres sont viables et engendrent des mutants qui peuvent éventuellement différer par leur signature antigénique. Cette grande variabilité rend difficile la vaccination.
Oncogénèse
Certains Rétrovirus possèdent en plus, un oncogène. Cet oncogène code une protéine de transformation. Cette protéine confère aux virus un fort pouvoir de transformation leur permettant d'induire très rapidement (quelques semaines) après l'infection, des tumeurs. Les protéines oncogéniques peuvent être de différentes natures :
- protéines impliquées dans l’activité enzymatique :
pp60 src (RSV), c'est une protéine kinase membranaire régulant le fonctionnement de nombreuses protéines.
- analogues de facteurs de croissance cellulaire ou de leurs récepteurs :
- Sis : analogue muté du PDGF, Sis se fixe sur le récepteur du PDGF.
- Erb : analogue muté du récepteur à l’EGF.
- protéines fixant la GTP :
Ras (active la voie des MAP Kinases)
- protéines à activité nucléaire :
Myc, Myb, Fos, sont des facteurs de transcription impliqués dans la prolifération cellulaire.
Organisation du génome
Le génome se décompose en différentes régions, ayant chacune un rôle bien défini. Orienté de 5' vers 3' :
- La séquence R : il s'agit d'une séquence répétée qui sert à former la première fibre d'ADN négative en permettant le premier saut réplicatif.
- U5 : une région unique qui joue un rôle dans la terminaison de la synthèse d'ARN viral.
- Séquence Leader : elle contient 2 parties
- PBS : pour Primer Binding Site, c'est le site d'attache de l'amorce pour la synthèse du brin d'ADN complémentaire par la TI. Le PBS est associé à un ARNt.
Puis, suivent les trois gènes de structure :
- gag : pour group specific antigens, c'est le gène qui code la polyprotéine structurale du virus, contenant les domaines de matrice (MA), capside(CA) et nucleocapside (NC).
- pol : (à l'origine pour polymerase) ce gène code la transcriptase inverse, l'intégrase qui permet l'intégration d'ADN bicaténaire viral dans l'ADN cellulaire, une protéase qui clive les domaines de Gag et Pol lors de la maturation, une endonucléase et une RNase H.
- env : (pour enveloppe) ce gène code des protéines d'enveloppe, les spicules.
Enfin, la dernière région :
- PBS : c'est le site d'attache de l'amorce pour la synthèse du brin d'ADN positive par la TI.
- U3 : contient le promoteur et l'enhancer pour la transcription du génome, ainsi que le signal de polyadénylation de l'ARN.
- Séquence R
