Mycota (classification phylogénétique) - Définition

Cette page a pour objet de présenter un arbre phylogénétique des Mycota (ou Fungi, ou encore Champignons), c'est-à-dire un cladogramme mettant en lumière les relations évolutives complexes (relations groupes ancestraux - groupes descendants) existant entre les différents organismes vivants ou taxa, constituant ce groupe. Du fait de ses méthodes nouvelles basées sur la biologie moléculaire, la phylogénie, science récente à l'origine de la classification phylogénétique du vivant, est en plein essor et propose parfois des résultats en contradiction avec l'ancienne classification, majoritairement basée, elle, sur des critères morphologiques et physiologiques. Aussi, certains points particuliers font parfois encore l'objet de débats au sein de la communauté scientifique. L'objectif, s'il y a lieu, est également de présenter ces derniers ici.

Ce cladogramme présente aussi bien les groupes encore représentés aujourd'hui que ceux qui sont éteints (incluant les groupes fossiles).

À la suite d'un taxon, sa période d'apparition, quand elle est connue, peut être indiquée suivant la légende suivante : (Plé) : Pléistocène ; (Pli) : Pliocène ; (Mio) : Miocène ; (Oli) : Oligocène ; (Éoc) : Éocène ; (Pal) : Paléocène ; (Cré) : Crétacé ; (Jur) : Jurassique ; (Tri) : Trias ; (Per) : Permien ; (Car) : Carbonifère ; (Dév) : Dévonien ; (Sil) : Silurien ; (Ord) : Ordovicien ; (Camb) : Cambrien. De plus, pour plus de précisions si possible, (-) : inférieur ; (~) : moyen ; (+) : supérieur.

Le symbole ▲ renvoie à la partie immédiatement supérieure de l'arbre phylogénétique du vivant. Le signe ► renvoie à la classification phylogénétique du groupe considéré.

Arbre phylogénétique

      ▲      └─o Fungi ou Mycota        ├─o        │ ├─o Neocallismatigomycetes ►        │ └─o Chytridiomycota s.s. ►        └─o          ├─o Blastocladiomycetes ►          └─o            ├─o            │ ├─o Entomophthoromycotina ►            │ └─o            │   ├─o Zoopagomycotina ►            │   └─o Kickxellomycotina ►            │     └─? Microsporidia ►            └─o              ├─?              │ ├─o Olpidiaceae               │ └─o Basidiobolales               ├─? Mucoromycotina ►              └─o Symbiomycota                ├─o Glomeromycota ►                └─o Dikarya                  ├─o Basidiomycota ►                  └─o Ascomycota ►      

En savoir plus

Sources bibliographiques de référence

• Yu Liu, Emma T. Steenkamp, Henner Brinkmann, Lise Forget, Hervé Philippe and B. Franz Lang : « Phylogenomic analyses predict sistergroup relationship of nucleariids and Fungi and paraphyly of zygomycetes with significant support », BMC Evolutionary Biology, vol. 9, n°272, 2009
• D. S. Hibbett, M. Binder, J. F. Bischoff, M. Blackwell, P. F. Cannon, O. E. Eriksson, S. Huhndorf, T. James, P. M. Kirk, R. Lucking, H. T. Lumbsch, F. Lutzoni, P. B. Matheny, D. J. McLaughlin, M. J. Powell, S. Redhead, C. L. Schoch, J. W. Spatafora, J. A. Stalpers, R. Vilgalys, M. C. Aime, A. Aptroot, R. Bauer, D. Begerow, G. L. Benny, L. A. Castlebury, P. W. Crous, Y.-C. Dai, W. Gams, D. M. Geiser, G. W. Griffith, C. Gueidan, D. L. Hawksworth, G. Hestmark, K. Hosaka, R. A. Humber, K. D. Hyde, J. E. Ironside, U. Koljalg, C. P. Kurtzman, K.-H. Larsson, R. Lichtwardt, J. Longcore, J. Miadlikowska, A. Miller, J.-M. Moncalvo, S. Mozley-Standridge, F. Oberwinkler, E. Parmasto, V. Reeb, J. D. Rogers, C. Roux, L. Ryvarden, J. P. Sampaio, A. Schüßler, J. Sugiyama, R. G. Thorn, L. Tibell, W. A. Untereiner, C. Walker, Z. Wang, A. Weir, M. Weiss, M. M. White, K. Winka, Y.-J. Yao et N. Zhang, « A higher-level phylogenetic classification of the Fungi », Mycol. Res., vol. 111, 2007, pp. 509-547
• Sina M. Adl et alii, « The New Higher Level Classification of Eukaryotes », J. Eukaryot. Microbiol., vol. 52, n°5, 2005, pp. 399–451
• François Lutzoni, Frank Kauff, Cymon J. Cox, David McLaughlin, Gail Celio, Bryn Dentinger, Mahajabeen Padamsee, David Hibbett, Timothy Y. James, Elisabeth Baloch, Martin Grube, Valérie Reeb, Valérie Hofstetter, Conrad Schoch, A. Elizabeth Arnold, Jolanta Miadlikowska, Joseph Spatafora, Désirée Johnson, Sarah Hambleton, Michael Crockett, Robert Shoemaker, Gi-Ho Sung, Robert Lücking, Thorsten Lumbsch, Kerry O’Donnell, Manfred Binder, Paul Diederich, Damien Ertz, Cécile Gueidan, Karen Hansen, Richard C. Harris, Kentaro Hosaka, Young-Woon Lim, Brandon Matheny, Hiromi Nishida, Don Pfister, Jack Rogers, Amy Rossman, Imke Schmitt, Harrie Sipman, Jeffrey Stone, Junta Sugiyama, Rebecca Yahr et Rytas Vilgalys, « Assembling the fungal tree of life: progress, classification, and evolution of subcellular traits », American Journal of Botany, vol. 91, n°10, 2004, pp. 1446–1480
• Anders Tehler, Damon P. Little et James S. Farris, « The full-length phylogenetic tree from 1551 ribosomal sequences of chitinous fungi, Fungi », Mycological Research, vol. 107, n° 8, 2003, pp. 901-916
• Thomas Cavalier-Smith, « A revised six-kingdom system of life », Biological reviews, vol. 73, 1998, pp. 203-266

Autres sources bibliographiques

Sources internet

• Arbre taxonomique de l'Inventaire national du Patrimoine naturel, partiel et non phylogénétique
• Tree of life [1]

Liens internes

• Arbre phylogénétique
• Classification systématique des champignons
• Eukaryota (classification phylogénétique)
  • Opisthokonta (classification phylogénétique)
• Mycota -- Champignon -- Lichen
• Photo-guide taxinomique du monde végétal
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