MicroARN - Définition
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Introduction
Les micro ARN (miRNA ou mi RNA) sont des ARN simple-brin longs d'environ 21 à 24 nucléotides.
Il existe plusieurs centaines de gènes de microARN dans les génomes de la plupart des organismes pluricellulaires. Les miRNA contrôlent l'expression des gènes ; ce sont des répresseurs post-transcriptionnels : en s'appariant à des ARN messagers, ils guident leur dégradation, ou la répression de leur traduction en protéine.
On a récemment montré (chez la mousse Physcomitrella patens), que des miARN pouvaient même directement se coller sur des gènes et les « éteindre », via une méthylation des séquences ARN codant les cibles des miARN. Il n'est pas exclus qu'un tel processus puisse aussi exister chez l'animal.
Biosynthèse
Les gènes de miRNA sont transcrits sous la forme de longs précurseurs appelés « pré-miRNA ». Ces précurseurs sont clivés dans le noyau par un complexe nommé Microprocesseur, et formé par les enzymes Drosha et DGCR8 (Di George Critical Region 8 ou Pasha) (chez les animaux) ; par une enzyme de la famille Dicer (chez les plantes); en un produit intermédiaire appelé « pre-miRNA ». Le pre-miRNA est un ARN long d'environ 70 nucléotides, replié en tige-boucle imparfaite par complémentarité de bases entre la première moitié et la deuxième moitié de sa séquence.
Ce pre-miRNA est transporté du noyau au cytosol par transport actif GTP-dépendant grâce à une interaction avec l'exportine 5 (chez les animaux).
Le pre-miRNA est ensuite clivé par une enzyme de la famille Dicer qui permet l'hydrolyse de la structure boucle (chez les animaux, cette réaction se déroule dans le cytoplasme ; elle est nucléaire chez les plantes), pour libérer un petit ARN double-brin appelé « miRNA ».
Ce miRNAdb (db=double brin) interagit alors avec une protéine de la famille Argonaute (Ago1 ou Ago2) pour former le complexe RISC (RNA-induced silencing complex). Ce complexe d'environ 160kDa a été décrit comme étant suffisant à l'activité de Gene silencing des miRNA, cependant d'autres protéines tel la Geminine peuvent s'y ajouter pour former des complexes allant jusqu'à 550kDa. Au cours de la formation du RISC il y a passage d'un miRNAdb à un miRNA sb (sb=simple brin). Seul le brin spécifique de l'ARNm cible du miRNA est gardé (réaction thermodynamique)au sein du complexe.
L'ARNm cible est alors chargé au sein du complexe RISC. Deux voies de "Silencing" sont alors possibles, soit la dégradation de l'ARNm cible si le complexe contient la protéine Ago2, soit la répression de la traduction de ce dernier si le complexe contient la protéine Ago1.
Les enzymes Dicer sont également responsables de la production de petits ARN interférents (ou siRNA) à partir de longs ARN double-brin, au cours du processus d'interférence à ARN. Ce processus a été décrit chez la plante comme pouvant être une défense antivirale.
miRNAs et virus
Quelques équipes ont étudié les interactions entre miRNAs et virus. En effet certains miRNA des cellules hôtes seraient capables de cibler des ARN viraux et confèrent un rôle antiviral à ces molécules (ref) ou au contraire permettant au virus de s'accumuler dans la cellule. Cette situation a été décrite pour le miRNA miR-122a spécifiquement exprimé dans le foie et favorisant la réplication de l'ARN du virus de l'hépatite B par une interaction dans sa séquence 5' non codante (Ref).
De plus, il semblerait que certains virus possèdent aussi des gènes codant des miRNAs au sein de leur génome. Ces derniers pourraient participer à une régulation des ARN viraux ou alors participeraient à une déstabilisation des miRNAs de l'hôte.
Un des gros challenges actuel est de pouvoir mieux identifier les gènes ciblés par ces miRNAs afin de mieux comprendre leur rôle et les conséquences de leur dérégulation dans les pathologies.
