La ligne 13 dessert deux gares parisiennes : la gare Saint-Lazare, trains pour la Normandie et le nord-ouest de l'Île-de-France, et la gare Montparnasse, à destination de l'ouest et du sud-ouest de la France. La station de métro Montparnasse — Bienvenue disposait d'un Trottoir roulant rapide (9 km/h) installé en 2002 dans le long couloir de correspondance. La RATP a annoncé en mai 2009 qu'il serait démonté et remplacé en mars 2011 par un trottoir roulant classique, en raison de « nombreuses réclamations de la clientèle relatives à la sécurité et au manque de fiabilité ».
La ligne traverse également plusieurs quartiers touristiques :
Enfin, le terminus à Saint-Denis — Université va voir à terme son intérêt accru avec le projet du centre des Archives nationales françaises à Pierrefitte-sur-Seine, juste à côté de cette station et de l'Université Paris VIII.
Cependant, les quartiers populaires traversés sur son tronçon nord aux taux de criminalité élevés provoquent chez certains usagers un sentiment d'insécurité à certaines heures.