En mars 2004 a été lancé la revue EAA Sport Pilot & Light-Sport Aircraft , tandis que l'acteur Harrison Ford succède au célèbre pilote d’essais Chuck Yeager à la présidence du programme Young Eagle. En septembre 2004, résultat d’efforts continus de l’EAA depuis sa création, une nouvelle réglementation sur les Avions Légers de Sport et une licence de pilote adaptée sont entrés en application aux États-Unis. L’EAA a donc entrepris une vaste campagne d’information sur les possibilités offertes par cette réglementation, mais aussi les structures à mettre en place pour en assurer le succès. Un premier Sport Pilot Tour a été organisé en mars 2005. En avril 2006 la FAA a accepté de revoir la question de l’aptitude médicale des pilotes et une nouvelle réglementation est en cours d’élaboration.
Après les attaques terroristes sur le World Trade Center et le Pentagone, l’EAA mettra toute son énergie à défendre l’aviation générale, utilisant tous ses contacts auprès de l’Administration Fédérale pour obtenir au plus vite la réouverture de l’espace aérien et à empêcher des restrictions irraisonnées au vol privé. En octobre 2001 il devient possible de créer un plan de vol sur Internet, service gratuit pour tout membre de l’EAA. AirVenture 2002 est l’occasion d’annoncer des facilités négociées avec certains assureurs pour les constructeurs amateurs, mais aussi de lancer une pétition contre une réglementation fédérale visant à interdire tout avion léger à moins de 5 km d’un événement public populaire ou d’un rassemblement en plein air. En septembre 2002 une autre pétition réclame la validation du permis de conduire comme certificat médical pour les titulaires de la licence de ‘pilote de loisir’. En octobre 2003 un million de baptêmes de l’air ont été donnés à des enfants dans le cadre du programme Young Eagle.