Commencé en 1891, il a été mis en service à la fin du XIXe siècle ou au début du XXe siècle pour faciliter le trafic maritime. Il a été utilisé par des cargos jaugeant jusqu'à 1 200 tonneaux de port en lourd, acheminant des bois du Nord et des céréales jusqu'à la fin des années 1990. Le trafic portuaire était d'environ 10 000 tonnes par an dans la dernière décennie de son exploitation.
Depuis la cessation définitive du trafic maritime, le port fluvial de Marans est devenu un port de plaisance au début des années 2000, où les bateaux de plaisance utilisent le canal de dérivation qui leur facilite grandement la navigation.