Les acides aminés sont les unités de base de construction des protéines. Ils forment soit des chaînes courtes d'acides aminés appelés peptides (si la chaîne est inférieure à 50 acides aminés) soit des chaînes longues appelées polypeptides ou des protéines (si la chaîne est supérieure à 50 acides aminés). Ces polymères sont linéaires et non ramifiés. Le processus de fabrication des protéines est appelé traduction et se fait par ajouts successifs d'acides aminés à une protéine en cours de construction par une chaîne de ribozymes que l'on appelle un ribosome. L'ordre dans lequel les acides aminés sont ajoutés est déterminé par le code génétique de l'ARNm qui est une copie d'ARN de l'un des gènes de l'organisme. Vingt acides aminés sont codés par le code génétique standard et sont appelés acides aminés standards.
Les acides aminés aromatiques sont les acides aminés qui comportent un cycle aromatique dans leur chaine latérale. Ils sont au nombre de trois ; la phénylalanine, la tyrosine et le tryptophane. Ils sont mis en évidence par la réaction xanthoprotéique.
Nom | Code à 1 lettre | Code à 3 lettres | Masse molaire (g.mol-1) | pI | pKa1(-COOH) | pKa2 (-NH2) | pKaR (-R) | Abondance relative |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Alanine | A | Ala | 89,09 | 6,11 | 2,35 | 9,87 | 7,86 | |
Arginine | R | Arg | 174,20 | 10,76 | 1,82 | 8,99 | 12,48 | 5,39 |
Asparagine | N | Asn | 132,12 | 5,41 | 2,14 | 8,72 | 4,15 | |
Aspartate | D | Asp | 133,10 | 2,85 | 1,99 | 9,90 | 3,90 | 5,34 |
Cystéine | C | Cys | 121,16 | 5,05 | 1,92 | 10,70 | 8,18 | 1,51 |
Glutamate | E | Glu | 147,13 | 3,15 | 2,10 | 9,47 | 4,07 | 6,66 |
Glutamine | Q | Gln | 146,15 | 5,65 | 2,17 | 9,13 | 3,95 | |
Glycine | G | Gly | 75,07 | 6,06 | 2,35 | 9,78 | 6,94 | |
Histidine | H | His | 155,16 | 7,60 | 1,80 | 9,33 | 6,04 | 2,29 |
Isoleucine | I | Ile | 131,17 | 6,05 | 2,32 | 9,76 | 5,91 | |
Leucine | L | Leu | 131,17 | 6,01 | 2,33 | 9,74 | 9,64 | |
Lysine | K | Lys | 146,19 | 9,60 | 2,16 | 9,06 | 10,54 | 5,93 |
Méthionine | M | Met | 149,21 | 5,74 | 2,13 | 9,28 | 2,37 | |
Phénylalanine | F | Phe | 165,19 | 5,49 | 2,20 | 9,31 | 3,97 | |
Proline | P | Pro | 115,13 | 6,30 | 1,95 | 10,64 | 4,81 | |
Pyrrolysine | O | Pyl | 255,3134 | |||||
Sélénocystéine | U | Sec | 168,053 | 5,2 | ||||
Sérine | S | Ser | 105,09 | 5,68 | 2,19 | 9,21 | 6,83 | |
Thréonine | T | Thr | 119,12 | 5,60 | 2,09 | 9,10 | 5,41 | |
Tryptophane | W | Trp | 204,23 | 5,89 | 2,46 | 9,41 | 1,14 | |
Tyrosine | Y | Tyr | 181,19 | 5,64 | 2,20 | 9,21 | 10,46 | 3,04 |
Valine | V | Val | 117,15 | 6,00 | 2,39 | 9,74 | 6,73 |
|