Acide aminé - Définition

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Présence et fonctions en biochimie

Acides aminés standards

La structure primaire d'une protéine est une chaine d'acides aminés
Two amino acids are shown next to each other. One loses a hydrogen and oxygen from its carboxyl group (COOH) and the other loses a hydrogen from its amino group (NH2). This reaction produces a molecule of water (H2O) and two amino acids joined by a peptide bond (-CO-NH-). The two joined amino acids are called a dipeptide.
Condensation de deux acides aminés pour former un dipeptide

Les acides aminés sont les unités de base de construction des protéines. Ils forment soit des chaînes courtes d'acides aminés appelés peptides (si la chaîne est inférieure à 50 acides aminés) soit des chaînes longues appelées polypeptides ou des protéines (si la chaîne est supérieure à 50 acides aminés). Ces polymères sont linéaires et non ramifiés. Le processus de fabrication des protéines est appelé traduction et se fait par ajouts successifs d'acides aminés à une protéine en cours de construction par une chaîne de ribozymes que l'on appelle un ribosome. L'ordre dans lequel les acides aminés sont ajoutés est déterminé par le code génétique de l'ARNm qui est une copie d'ARN de l'un des gènes de l'organisme. Vingt acides aminés sont codés par le code génétique standard et sont appelés acides aminés standards.

Acides aminés aromatiques

Les acides aminés aromatiques sont les acides aminés qui comportent un cycle aromatique dans leur chaine latérale. Ils sont au nombre de trois ; la phénylalanine, la tyrosine et le tryptophane. Ils sont mis en évidence par la réaction xanthoprotéique.

Liste des principaux acides aminés

Liste des 22 acides aminés représentés dans le code génétique

Nom Code
à 1 lettre
Code
à 3 lettres
Masse molaire
(g.mol-1)
pI pKa1(-COOH) pKa2 (-NH2) pKaR (-R) Abondance relative
Alanine A Ala 89,09 6,11 2,35 9,87 7,86
Arginine R Arg 174,20 10,76 1,82 8,99 12,48 5,39
Asparagine N Asn 132,12 5,41 2,14 8,72 4,15
Aspartate D Asp 133,10 2,85 1,99 9,90 3,90 5,34
Cystéine C Cys 121,16 5,05 1,92 10,70 8,18 1,51
Glutamate E Glu 147,13 3,15 2,10 9,47 4,07 6,66
Glutamine Q Gln 146,15 5,65 2,17 9,13 3,95
Glycine G Gly 75,07 6,06 2,35 9,78 6,94
Histidine H His 155,16 7,60 1,80 9,33 6,04 2,29
Isoleucine I Ile 131,17 6,05 2,32 9,76 5,91
Leucine L Leu 131,17 6,01 2,33 9,74 9,64
Lysine K Lys 146,19 9,60 2,16 9,06 10,54 5,93
Méthionine M Met 149,21 5,74 2,13 9,28 2,37
Phénylalanine F Phe 165,19 5,49 2,20 9,31 3,97
Proline P Pro 115,13 6,30 1,95 10,64 4,81
Pyrrolysine O Pyl 255,3134
Sélénocystéine U Sec 168,053 5,2
Sérine S Ser 105,09 5,68 2,19 9,21 6,83
Thréonine T Thr 119,12 5,60 2,09 9,10 5,41
Tryptophane W Trp 204,23 5,89 2,46 9,41 1,14
Tyrosine Y Tyr 181,19 5,64 2,20 9,21 10,46 3,04
Valine V Val 117,15 6,00 2,39 9,74 6,73

Structure des 20 acides aminés standards représentés dans le code génétique

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