Le second capitaine est l'adjoint du commandant du navire. Il est fréquemment en charge de la sécurité du navire mais est surtout responsable du chargement. Il est le chef du service pont, responsable de l'entretien du navire (maintenance générale, cosmétique, etc.). Il a sous ses ordres un ou plusieurs lieutenants ainsi que l'équipe pont (maître d'équipage et matelots). Le second est également généralement désigné comme agent de sûreté du navire (ISPS).