Guillaume Pépy est un homme d'affaires français.
Diplômé de l’Institut d'études politiques de Paris et ancien élève de l’ENA, il a débuté sa carrière dans la haute administration, au Conseil d'État, comme maître de requêtes (1987) puis secrétaire général adjoint de cette institution (1988).
Il collabore à plusieurs cabinets ministériels, conseiller technique du ministre du Budget (1988), directeur des cabinets du ministre de la Fonction publique et de la ministre du Travail.
Directeur général adjoint chargé du développement du groupe Sofres (1995-1997).
Il rejoint la SNCF en 1997 où il assume d’importantes fonctions de Direction jusqu’à sa nomination en 2003 en qualité de directeur général exécutif. Guillaume Pépy est également président du conseil d’administration d’Eurostar et président de voyages.sncf.com
Libération a rapporté en octobre 2005 (article) que Guillaume Pépy tient un blog sur l'intranet de la SNCF. Ce blog, clos en juillet 2006, est de nouveau en ligne depuis janvier 2007.